home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ BCI NET 2 / BCI NET 2.iso / archives / demos / misc / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00775 < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  27 lines
  1. ***************************************************
  2. * Transcription termination factor nusG signature *
  3. ***************************************************
  4.  
  5. The nusG  protein  [1,2] is a bacterial transcriptional elongation factor that
  6. influences transcription   termination  and  antitermination.  It  acts  as  a
  7. component of  the  transcription  complex,  and interacts with the termination
  8. factor rho and RNA polymerase.
  9.  
  10. NusG is  a  protein  of  177 to 353 amino-acid residues [3,4] whose C-terminal
  11. sequence is  well  conserved.  We  have developed a signature pattern from the
  12. most conserved part of nusG.
  13.  
  14. -Consensus pattern: [LIVM]-F-G-R-x-T-P-V-x-[LIVM]
  15. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  16. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  17. -Last update: June 1994 / First entry.
  18.  
  19. [ 1] Li J., Horwitz R., McCracken S., Greenblatt J.
  20.      J. Biol. Chem. 267:6012-6019(1992).
  21. [ 2] Li J., Mason S.W., Greenblatt J.
  22.      Genes Dev. 7:161-172(1993).
  23. [ 3] Heinrich T., Schroeder W., Erdmann V.A., Hartmann R.K.
  24.      J. Bacteriol. 174:7859-7863(1992).
  25. [ 4] Miyake K., Onaka H., Horinouchi S., Beppu T.
  26.      Biochim. Biophys. Acta 1217:97-100(1994).
  27.